阿克苏职业技术学院马克思主义学院（以下简称马院）是学院党委直属的独立的二级教学单位。在学校党委的高度重视下，于2019年9月16日率先在南疆高职院校成立第一个马克思主义学院，主要承担全院本科、高职、中职各学段各专业12门思政理论课教学任务。近年来，马院立项省部级课题三项，地厅级课题八项，自治区重点课程两门，获自治区及以上思政大赛奖项近20项，积极发挥思政课是落实立德树人根本任务关键课程的作用。

马院党总支按学院党委要求，坚持“以党建立根、用思政铸魂”，以自治区“双培双带”工作室和自治区样板党支部为抓手，通过“五个提升”、“五个维度”、“五个活动”突出党建与中心工作双融双促，承担学院党校培训任务，建设 “1313”党建工作体系，积极打造“党建+思政”品牌工程建设，推进实现“七个全覆盖”从有形向有效转变，是地区党建示范建设重要参观点之一。

马院始终秉承“明德砺行、守正创新”的院训精神，坚持习近平总书记的“马院姓马、在马言马”“让有信仰的人讲信仰”的要求，已建有学院思政教育理实一体化实践教学基地、习近平新时代中国特色社会主义思想青年研究社、地区柯柯牙文润工作室、地区思政教育研究中心、地区大中小思政课一体化建设研修基地等多个教研、科研、思政教育平台，已成为地区有一定影响力的思政教育教学基地、马克思主义理论研究基地、红色文化宣讲基地、思政教师培训基地、党员团员教育基地。